สัญลักษณ์ของคณะเซนต์ปอล เดอ ชาร์ตร เป็นรูปสี่เหลี่ยม มีโล่อยู่ตรงกลาง ความหมายของโล่เป็นดังนี้ 

โล่ เป็นรวงข้าวตั้งตรง สูงเท่ากัน 4 รวง ซึ่งบ่งบอกถึงความซื่อสัตย์ ความราบเรียบ และความเท่าเทียมกันในหมู่ภคินี 4 คนแรกรวงข้าวเขียวสด คือการเริ่มต้นภคินี ที่แม้จะเยาว์วัย แต่ทำงานหนักเกินกำลัง เพื่อเป็นการพลีชีพ ประดุจเมล็ดพืชเล็กๆที่ตกลงสู่พื้นดิน พื้นสีทอง หมายถึงความสว่างที่เจิดจ้าหลังวันแห่งความมืดมนแห่งท้องทุ่งที่ราบโบส เดอ ชาร์ตร เป็นชื่อที่สอง บอกถึงบ้านแม่ซึ่งเป็นหัวใจ และศูนย์รวมเอกภาพของภคินี ตั้งอยู่ใกล้อาสนวิหารพระมารดาแห่งชาร์ตร ประเทศฝรั่งเศส สีแดง สีแห่งความรัก สีเลือด เลือดแห่งความตาย และความกล้าหาญของนักบุญเปาโลมรณสักขี องค์อุปถัมภ์ของภคินีผู้ถือดาบแห่งพระวาจา ชูรับความมีชัย พร้อมจะประกาศข่าวดีแห่งความจริงแก่ทุกคนที่ได้พบ บทจดหมายที่เปิดอยู่  มีคำจารึกว่า “จงเป็นทุกอย่างสำหรับทุกคน” บ่งบอกถึงฐานะผู้รับใช้ของภคินีในการนำมนุษย์ให้รอด เพื่อเทิดพระเกียรติพระเจ้าภาษาลาติน 3 คำ คือ REGULARITE (ซื่อสัตย์) SIMPLICITE (ราบเรียบ) TRAVAIL (การงาน) เป็นการเตือนใจ ให้ยึดถือและปฏิบัติในคุณธรรมของความซื่อสัตย์ สุภาพราบเรียบ และขยันขันแข็งในการทำงาน

สัญลักษณ์ของโรงเรียน ประกอบด้วยปริมณฑลภายในวงกลม มีเส้นขอบและมีเส้นโค้งลงประดับรอบนอกบังเกิดเป็นกลีบ เจ็ดกลีบกลางปริมณฑลมี โล่ป้องกันศัสตราวุธภายในโล่แบ่งออกเป็นสามส่วน ส่วนบนมีอักษร ซ.ย. อยู่หน้าเส้นตรงตั้งส่วนกลาง เส้นว่าง ส่วนล่างมีตะเกียงเปล่งประทีปวางอยู่บนหนังสือสองเล่มซ้อน มีเส้นนอนเป็นฐาน มีดาบขัดอยู่หลังโล่ ปลายดาบปรากฏที่ด้านบนซ้าย ด้านดาบปรากฏที่ด้านล่างขวา มองเห็นใบไม้ทอดปลาย ด้านบนขวาและด้านล่างซ้ายความหมายวงกลม คือ ความมุ่งหมายร่วมกันในการพัฒนา เยาวชน ให้เป็นบุคคลผู้มีคุณสมบัติ ครบถ้วนตามคุณค่าแห่งศาสนธรรม วัฒนธรรม และวิชาความรู้ ขณะเดียวกัน ก็หมายถึง การรวมศรัทธาธรรม ของนักบวชเข้ากับความรักของผู้ปกครอง เมตตาธรรมของครู และการแสวงหาความรู้ความเจริญของนักเรียนเส้นประดับเจ็ดกลีบ แทนพระคุณเจ็ดประการของพระจิตเจ้า (พระดำริ สติ ปัญญา ความคิดอ่าน พละกำลัง ความรู้ ความศรัทธา ความยำเกรง)โล่ แสดงนัยของคุณธรรมว่า ความรู้เป็นเครื่องปกป้องภัยดาบคม คือ ปัญญา ด้าม คือ สติ ดาบนี้เป็นเครื่องประหารความเขลาและความไม่ชอบธรรมทั้งหลาย และป้องกันตนเอง จึงต้องใช้ความสุขุมคัมภีรภาพอย่างองอาจ และกล้าหาญ ใบไม้ แทนใบมะกอก ใบของพืช คือส่วนที่ทำหน้าที่หายใจ ใบมะกอกจึงแทนการดำรงชีวิตในสันติสุข

สัญลักษณ์ดอกลิลลี่ (FLEUR DE LIS)
คณะภคินีเซนต์ปอล เดอ ชาร์ตร ได้เลือกดอกลิลลี่เป็นสัญลักษณ์ของตราประจำโรงเรียน เพราะดอกลิลลี่มีสีขาว เปรียบเสมือนความบริสุทธิ์ ซื่อสัตย์ จงรักภักดีและเที่ยงตรง ดอกลิลลี่ผุดขึ้นจากดินชูก้านตรงสู่ความไพศาลและความสว่าง ความงดงามของดอกลิลลี่ สีขาวเป็นที่ชื่นชมเปรียบได้กับปรัชญาชีวิตว่าเจ้าของชีวิตที่ว่า มนุษย์พึงพัฒนาตนด้วยความตรงสองประการ คือ ซื่อตรง เที่ยงตรง พร้อมทั้งมีความถ่อมตน สุภาพ และหนักแน่นอยู่เป็นนิจ ดุจดังแผ่นพื้นพสุธา สีขาวซึ่งเปรียบเสมือนความบริสุทธิ์ เป็นความงามประจำตนและเป็นแบบฉบับ แม้ต้นกำเนิดจะอยู่ในที่อับ ก็พึงเจริญชีวิตสู่ความสว่างให้เป็นที่ประจักษ์



สีและต้นไม้ประจำโรงเรียน
สัญลักษณ์สีประจำโรงเรียน คือ ม่วง-ทอง ประกอบขึ้นเป็นคุณธรรมที่นำมาซึ่งจิตใจที่ราบเรียบ สงบและเยือกเย็น อันก่อให้เกิดความดีทั้งปวง  

สีม่วง เป็นสีแห่งความราบเรียบ สุขุม รอบคอบ และเยือกเย็น เป็นจุดสำคัญและจุดเด่นในการต่อสู้กับอุปสรรคและอันตรายทั้งปวงเพื่อให้บรรลุจุดมุ่งหมาย โดยคำนึงถึงความถูกต้อง ความยุติธรรม และ ความรักสามัคคีของหมู่คณะ


สีทอง เป็นสีแห่งคุณธรรม การแสดงคุณธรรมความดี ตั้งมั่นอยู่ในหลักของธรรมย่อมจะพาชีวิตให้พัฒนาสู่ความเจริญก้าวหน้ายิ่งขึ้น

ต้นประดู่เหลือง เป็นต้นไม้ยืนต้นขนาดกลางถึงขนาดใหญ่ ใบเป็นช่อแตกออกจากปลายกิ่ง ลักษณะของใบเป็นรูปมนรีปลายใบแหลม โคนใบมน ขอบใบเรียบเป็นมัน สีเขียว ดอกมีขนาดเล็กสีเหลือง ออกดอกเป็นช่อตามปลายกิ่งระดมกันบานเต็มต้น ดูลานตา หมายถึง ศิษย์ของเซนต์โยเซฟ บางนา เป็นผู้ที่มีความพร้อม ความร่วมมือ ร่วมใจสามัคคี มีพลังเป็นอันหนึ่งอันเดียวกัน เพื่อนำไปสู่ความสำเร็จในการดำเนินชีวิตอย่างมีความสุข

ประดู่บ้าน
พันธุ์ไม้พระราชทานเพื่อปลูกเป็นมงคลจังหวัดภูเก็ต

ชื่อวิทยาศาสตร์ Pterocrpus INDICTS WILD
ชื่อวงศ์ LEGUMINOSAE
ชื่ออื่น ประดู่กิ่งอ่อน สะโน อังสนา

เป็นไม้ต้นขนาดกลาง ผลัดใบ สูง ๑๕-๓๐ เมตร เรือนยอดรูปกลมหรือรูปร่าง ทึบ ปลายกิ่งห้อยย้อยลง เปลือกสีน้ำตาลคล้ำ แตกเป็นสะเก็ดทั่วไป เปลือกในมีน้ำเลี้ยงสีแดง ใบ ประกอบขนนก เรียงสลับ ใบย่อยเรียงสลับกัน ๔-๑๐ ใบ ดอก รูปดอกถั่วสีเหลือง กลิ่นหอมอ่อนๆ ออกรวมกันเป็นช่อตามง่ามใบหรือปลายกิ่งช่อยาว ๒๐-๓๐ เซนติเมตร ผล รูปโล่ มีครีบเป็นแผ่นกลม ตรงกลางนูน กว้าง ๓-๔ เซนติเมตร
นิเวศวิทยา พบในป่าดิบภาคใต้ตั้งแต่จังหวัดชุมพรลงไปสามารถปลูกได้ทั่วไป ออกดอก มีนาคม - เมษายนดอกจะบานเกือบพร้อมกันและโรย พร้อมกัน ขยายพันธุ์ โดยเมล็ดและปักชำกิ่ง
ประโยชน์ ปลูกเป็นไม้ให้ร่มเงา เป็นไม้ประดับ เนื้อแก่นสีแดงทำมาเป็นสีย้อมผ้า เปลือกแก้ท้องเสียใบและดอกอ่อนรับประทานเป็นผัก น้ำต้มจากใบใช้มาสระผม