- วันที่ 1 ธันวาคม 2559 สำนักงานคณะกรรมการส่งเสริมการศึกษาเอกชน แจ้งมอบเกียรติบัตรโรงเรียนที่มีผลการทดสอบระดับชาติ O - NET เป็นไปตามเกณฑ์ที่กำหนด โรงเรียนได้รับเกียรติบัตร 2 ระดับ ดังนี้
- เกียรติบัตรเหรียญเงิน ระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ 6
- เกียรติบัตรเหรียญทองแดง ระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3
โรงเรียนได้รับรางวัลถ้วยพระราชทานรางวัลเครื่องดนตรีดีเด่นระดับมัธยมศึกษา ระดับนักเรียนภาคตะวัีนออก ครั้งที่ 36 จากการแข่งขันดนตรีไทยชิงถ้วยพระราชทานสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ณ มหาวิทยาลัยบูรพา
โรงเรียนได้รับเกียรติบัตร โรงเรียนเอกชนประเภทสามัญศึกษาที่มีผลประเมินคุณภาพสู่มาตรฐานสากล ระดับดีมาก ปีการศึกษา 2558 จากสำนักคณะกรรมการส่งเสริมการศึกษาเอกชน
สำนักงานรับรองมาตรฐานและประเมินคุณภาพการศึกษา (องค์การมหาชน) มอบเกียรติบัตรสถานศึกษาดีเด่นให้โรงเรียนเซนต์โยเซฟ บางนา เนื่องจากได้รับผลประเมินคุณภาพภายนอกระดับคุณภาพดีมากทั้งสามรอบการประเมิน
โรงเรียนได้รับรางวัลเกียรติบัตรโรงเรียนเอกชนที่มีผลการทดสอบระดับชาติขั้นพื้นฐาน (O-NET) รางวัลเหรียญเงิน ในระดับประถมศึกษาปีที่ 6 และรางวัลเหรียญทองแดง ในระดับมัธยมศึกษาปีที่ 3 เป็นเวลาต่อเนื่อง 4 ปีซ้อน จากคณะกรรมการการศึกษาเอกชน (สช.)
รางวัลเหรียญเงินและใบประกาศนียบัตรการแข่งขันคณิตศาสตร์และวิทยาศาสตร์โอลิมปิก ระหว่างประเทศ ระดับประถมศึกษาประจำปีการศึกษา 2558 จากสำนักงานคณะกรรมการศึกษาขั้นพื้นฐาน
รางวัลเหรียญทองในการแข่งขันทางวิชาการ ระดับนานาชาติ ประจำปี พ.ศ. 2557 (ระดับประเทศ) วิชาวิทยาศาสตร์ ระดับชั้นประถมศึกษาของสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน
รางวัลเหรียญทองแดงการแข่งขัน Skate Malaysia ZA Southeast Asia's Favorrite competitive. ในรายการ Artistic (FS4) และ Interpretive (FS4)
รับถ้วยรางวัลชนะเลิศอันดับที่ 1 รุ่นอายุ 14 ปี หญิง กลุ่ม B ได้ 5 เหรียญทอง 3 เหรียญเงิน ทำลายสถิติใหม่ งานพระหฤทัยดอนเมืองแชมป์เปี้ยนชิฟต้านยาเสพติดครั้งที่ 7